Основными целями деятельности Совета являются:

• Изучение состояния биомедицинских исследований в России;
• Морально нравственная и правовая экспертиза экспериментальной и научно-практической деятельностии в области биомедицины;
• Представительство в международных общественных движениях и организациях по этическим проблемам современной биомедицины;
• Информирование и консультирование широких слоев православной и российской общественности по этическим проблемам современной медицины;

Темы, рассматриваемые Советом: эвтаназия, фетальная терапия, новые репродуктивные технологии, трансплантация, "планирование семьи", генетика, наркология, аборты и др.
В совет по биоэтике входят представители православных медицинских организаций, священники-врачи, эксперты по отдельным областям медицины. Состав Совета утвержден Патриархом Московским и всея Руси Алексием.

Официальные документы, принятые Советом

• Обращение к В.И. Матвиенко
• О праве врача отказаться от производства абортов
• Заявление о демографической ситуации в России
• Заявление о необходимости запрещения рекламы табачных и вино-водочных изделий
• Заявление о проекте Федерального закона "О традиционной и народной медицине (целительстве)"
• Заявление "О фетальной терапии"
• Заявление "Об этической недопустимости клонирования человека"
• Заявление о проекте Федерального закона "О здравоохранении в Российской Федерации"
• Заявление "О нравственных проблемах,связанных с развитием репродуктивных технологий"
• Заявление "О современных тенденциях легализации эвтаназии в России"
• Присяга врача России (Предложена Церковно-общественным советом по биоэтике)
• Заявление "О пренатальной диагностике"
• Заявление "О негативных последствиях государственного финансирования методик искусственного оплодотворения"
• Сборник трудов Церковно-общественного совета по биоэтике при Московской Патриархии. Выпуск 1.